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[会议信息] 第六届DPABI/DPARSF特训营暨DPABISurf加强营 [复制链接]

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发表于 2019-8-29 16:53:38 |只看该作者 |倒序浏览
本帖最后由 LarsLu 于 2019-8-29 16:53 编辑

日前,DPABISurf已随DPABI V4.1正式发布。DPABISurf是基于大脑皮层的脑成像数据分析软件,解决了基于体空间分析忽视大脑按皮层延展的特性的问题,提高了脑信号提取的敏感性和特异性。DPABISurf可以计算大脑皮层厚度、面积和曲率,还可以计算基于皮层的ALFF/fALFF、ReHo、Degree Centrality和功能连接图等。DPABISurf提供基于皮层的图像统计和显示功能,并可独立于MATLAB运行。DPABISurf的使用如同DPABI软件一样简单,但手把手的实战培训能够让学员以最正确有效的方式精通DPABISurf皮层分析。兹定于2019年10月26日至28日举办为期三天的第六届DPABI/DPARSF特训营暨DPABISurf加强营(为DPABI/DPABISurf/DPARSF国内独家授权培训)。

本届DPABI/DPARSF特训营暨DPABISurf加强营由严超赣研究员主讲,面向心理学、认知bet36娱乐_bet36备用网址大全_bet36体育在线备用、生物医学工程学、临床医学等领域的科研人员和研究生,及希望在该领域进行深造的高年级本科生。在特训营中,学员将系统学习R-fMRI领域的基本概念以及DPABI/DPABISurf/DPARSF软件的相关操作。更为重要的是,鼓励学员带着自己的项目和数据前来学习,与导师进行深入的研究项目讨论,带着研究问题对数据进行处理,接受手把手的系统科研培训,对得到的研究结果进行科学阐释

本届特训营诚挚欢迎您的参与,期待与您在北京相见!

一、时间:2019年10月26日——2019年10月28日

二、地点:清华科技园阳光厅清华幸福科技实验室会议室



三、授课教师(http://lab.rfmri.org/People严超赣研究员

DPABI/DPABISurf/DPARSF创始人,中国科学院心理研究所研究员,博士生导师,心理所磁共振成像研究中心副主任,脑功能成像实验室PI。2006年毕业于北京科技大学获学士学位,2011年毕业于北京师范大学获博士学位。随后赴美留学,在美国内森克兰精神病学研究所和纽约大学儿童与青少年精神病学系先后担任研究科学家(Research Scientist)和研究助理教授(Research Assistant Professor)职位。2015 年作为中国科学院“百人计划”研究员加入中国科学院心理研究所工作。严超赣博士的主要研究领域集中在静息态功能磁共振方法学、数据分析软件平台、脑自发活动机制及其在脑疾病中的应用。他为一系列困扰静息态功能磁共振成像的方法学问题提出了广受领域认可和引用的解决方案,包括头动、标准化和多重比较校正等。他还对静息态功能磁共振成像的计算方法进行了规范化,建立了被引1600余次的脑成像流水线式计算平台DPARSF,并建立了脑成像分析与共享平台DPABI和基于大脑皮层的脑成像数据分析软件DPABISurf。他将静息态功能磁共振成像应用于抑郁症研究,发现了早期不良抚育可致大脑自发活动异常发育,与后期抑郁样行为有关。他牵头建立了抑郁症脑成像大数据联盟(REST-meta-MDD),并积极与ENIGMA-MDD等国际组织展开国际抑郁症脑成像大数据合作研究。他在国际主流学术期刊(如Cerebral Cortex, NeuroImage, Human Brain Mapping, Translational Psychiatry,Neuroinformatics等)共发表50余篇学术论文,其中20余篇为第一作者和/或通讯作者。研究成果得到国际同行的高度关注,总引用8000余次,h指数27(Google Scholar)。第一/通讯作者论文中,有4篇入选ESI Top 1%高被引论文,其中有2篇更入选ESI Top 1‰高被引论文。他是《NeuroImage》和《Journal of Neuroscience Methods》等国际期刊编委,国际人脑图谱学会通讯委员会(OHBM Communications Committee)委员。




四、授课内容


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日期

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时间



授课内容


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10月26日

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上午(9:00~12:00)



开营仪式



静息态功能磁共振原理与数据分析



静息态功能磁共振在心理学和脑疾病的应用



下午(14:00~17:00)



学员项目介绍



R-fMRI数据预处理:DPARSF



基于大脑皮层的数据分析与DPABISurf简介



晚上(19:00~21:00)



软件安装与手把手操作练习


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10月27日

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上午(9:00~12:00)



R-fMRI质量控制与The R-fMRI Maps Project



DPABI动物数据处理



R-fMRI动态性分析



统计分析、多重比较校正与结果显示



下午(14:00~17:00)



DPABISurf数据处理



DPABI统计分析实战



晚上(19:00~21:00)



学员自有数据处理


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10月28日

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上午(9:00~12:00)



R-fMRI可重复性及多重比较校正选择



DPABI??Utilities介绍



DPABISurf进阶



脑成像MATLAB编程初探



下午(14:00~17:00)



学员项目结果汇报







五、学员要求

学员对象为心理学、医学、生物学、计算机、教育学等领域的教研人员、研究生或高年级本科生。为保证学习质量,培训班参加人员总数限制为30 名。

参加培训人员需自带笔记本电脑并提前安装好DPABI软件及示例数据(推荐携带自有数据),具体说明可查阅:

http://rfmri.org/DPABI

http://www.rfmri.org/DemoData

六、学费和报名方式:

1) 特训:人民币7999元/人。请携带苹果电脑或内存16G以上的Windows 10电脑。费用包括Windows10专业版升级费、DPABISurf安装服务费、会议服务费、培训费、材料费和场地费。交通食宿自理。

2) 特训+DPABI教育工作站套装:人民币15499元/人。费用除(1)中特训外,含价值¥8999的DPABI教育工作站一台(已预装Windows 10专业版和DPABISurf,为14英寸轻薄窄边框商务办公笔记本电脑:八代四核八线程i5-8250U, 16G内存, 256G固态硬盘+1T机械硬盘, PCIe, 独立显卡, 指纹识别)。

注:由于DPABISurf大脑皮层计算需要极强的计算能力,建议用户购买高性能计算机,或选购DPABI系列高性能工作站(参加DPABI特训营可享受八五折优惠购买DPABI工作站),详情请参考:http://deepbrain.com/DPABICore


请至http://rfmri.org/DPABICamp2下载并填写“第六届DPABI/DPARSF特训营暨DPABISurf加强营报名回执”并发送至changzk@deepbrain.com完成报名;或者微信扫描下方二维码在手机上填写信息完成报名。


汇款账户信息(请务必在汇款附言出注明:姓名、单位和第六届DPABI培训字样)

开户银行:中国建设银行北京北环支行

户名:北京深度大脑科技有限公司

帐号:11050162540000000372


七、联系人

常志凯

电话:18745703101

邮箱:changzk@deepbrain.com

微信扫码报名:


为了支持青年学者积极学习DPABI/DPABISurf/DPARSF,本届特训营特针对学生及博士后推出Merit Award。申请者请填写“DPABI特训营学员Merit Award申请表”(http://rfmri.deepbrain.com/sites ... mp_Merit_Award.docx),描述所进行的项目,当前遇到的困难及对特训营的预期收获,发送至changzk@deepbrain.com。评审获得Merit Award的青年学者即可获得价值人民币3000元的特训营优惠。
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沙发
发表于 2019-9-26 14:33:41 |只看该作者
?2019年9月19日,严超赣研究员团队正式发布DPABISurf V1.2新版本!DPABISurf是基于大脑皮层的脑影像数据分析软件,解决了基于体空间分析忽视大脑按皮层延展的特性的问题,提高了脑信号提取的敏感性和特异性。DPABISurf可以计算大脑皮层厚度、面积和曲率;计算皮层下核团体积;计算基于皮层的ALFF/fALFF、ReHo、Degree Centrality和功能连接图;提供基于皮层的图像统计和显示功能。DPABISurf基于fMRIPrep ,结合了Freesurfer、ANTs、FSL等领域内最先进图像处理软件的特定模块,结合docker技术提供了更简洁友好的运行界面,并可独立于MATLAB运行。DPABISurf将皮层分析的技术门槛和学习难度大大降低,使得用户无需任何编程经验,即可熟练准确地进行大脑结构皮层重建和进行基于皮层的功能分析。
DPABISurf V1.2增加了关于DPABISurf结果的质量控制模块,可以在单个HTML文件里面分别检查所有被试的皮层重建质量、功能-结构像配准质量、结构像-标准空间配准质量。对于DPABISurf的体空间分析,可以生成组Mask以用于统计,并且可以针对扫描覆盖情况和头动情况进行被试选择。DPABISurf还增加了基于皮层的沟深与体积输出。在结果整理模块,不再打包冗余文件,并且会将fmriprep和freesurfer文件备份。在影像显示模块中,DPABI_VIEW可以调用DPABISurf_VIEW进行皮层显示,将图像先从体空间用freesurfer命令mri_vol2surf转到fsaverage皮层空间,然后进行皮层显示并制图。本版本更新需要用户同时更新dpabi docker文件。
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