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[spm操作] spm-mask [复制链接]

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发表于 4?天前 |只看该作者 |倒序浏览
本帖最后由 tantangege 于 2019-10-13 21:53 编辑

请教老师一下:我有三个组,SPM先用ANOVA得出三组间的差异区mask,然后做post-hoc分析。1、请问这个mask是应该A方案:Specify 2nd-level做two-sample T-tes这一步时放在explicit mask这里呢,还是应该B:在最后Results这一步时选择applying masking放置mask呢。我是A方案,但是我发现two-sample T-test等到的差异区全部不在ANOVA得到的mask里。


2、implicit和explicit,inclusive和exclusive分别代表什么含义呢?比如,在A方案,添加了自己的mask后,implicit选择yes还是no;B方案添加mask后,选择inclusive还是exclusive?


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发表于 3?天前 |只看该作者
1,A方案也不错,根据我的经验两者有些微的差异,但不大(具体原因我还没搞清楚)。
ANOVA的显着脑区是三组中任何两组有差异的脑区,且不分正负。所以你需要做三组被试两两对比的双样本t检验来看,而且正负差异都要看。你可以检查一下是否看了所有的对比。

2,implicit是根据数据本身的强度,SPM自动设置一个阈值,比如强度排在百分之八十以上的体素才会进行处理,才算mask的一部分,这种情况下每个被试的mask都是不同的。
explicit是你自己设置一个mask,只有mask中的数据才会被处理。此时implicit就是选No。
inclusive是指mask中的体素才会被处理;exclusive是mask之外的数据才会被处理。
空里流霜不觉飞,汀上白沙看不见。

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发表于 3?天前 |只看该作者
本帖最后由 tantangege 于 2019-10-14 16:51 编辑
空里流霜 发表于 2019-10-14 02:05
1,A方案也不错,根据我的经验两者有些微的差异,但不大(具体原因我还没搞清楚)。
ANOVA的显着脑区是三组 ...

嗯,谢谢师兄。我重新次确认了一下,确实差异区都在mask内。
1、您的意思是A方案(explicit添mask + implicit选no)与B方案(applying添mask + 选择inclusive)都是可以的,都是只计算该mask内两两之间的差异哈。
2、不过,我发现在ANOVA时几乎没有区域能通过 uncorrected P<0.001水平,或是voxel-level FDR矫正(P <0.05),所以我选择了uncorrected P <0.005来提取mask,然而在Two-sample T-test时,这个mask内却有很多区域能通过uncorrected P<0.001水平,甚至是voxel-level的FDR矫正(P <0.05)。请问这个是啥原理咧


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发表于 3?天前 |只看该作者
tantangege 发表于 2019-10-14 00:28
嗯,谢谢师兄。我重新次确认了一下,确实差异区都在mask内。
1、您的意思是A方案(explicit添mask??...

1,是这个意思。
2,原因我不是特清楚,我没有系统比对过。不过能通过校正主要是因为是在mask之内比较的,其实就是使用了small volume correction。
空里流霜不觉飞,汀上白沙看不见。

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发表于 前天?09:05 |只看该作者
本帖最后由 tantangege 于 2019-10-15 09:06 编辑
空里流霜 发表于 2019-10-14 22:12
1,是这个意思。
2,原因我不是特清楚,我没有系统比对过。不过能通过校正主要是因为是在mask之内比较的 ...

嗯,好的,谢谢师兄耐心指导。

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发表于 前天?11:03 |只看该作者
tantangege 发表于 2019-10-14 20:05
嗯,好的,谢谢师兄耐心指导。

好!
空里流霜不觉飞,汀上白沙看不见。
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